单细胞转录组测序（Single cell RNA sequencing, scRNA-seq）是在单细胞水平上对转录组进行测序的一项新技术，可以研究单个细胞内的基因表达情况。这项技术解决了用组织样本测序无法解决的细胞异质性难题，使得解析单个细胞的行为、机制及其与机体的关系成为了现实。
能够在单个细胞水平上研究基因表达，解决细胞异质性的难题。
可以识别各种细胞类型亚群，并研究它们的功能和特性。
研究细胞的异质性、发育分化、分子调控机制等。
避免传统的转录组测序基于组织中所有细胞表达量的均值。
可以与其他技术如染色质可及性测序等结合，进行多组学的综合分析。
本研究生成了在出生后 4 个时间点（第 30、42、150 和 730 天）的 84,824 个猪肝细胞的单细胞转录组图谱，发现了 23 种细胞类型，包括三种罕见的细胞类型：浆细胞样树突状细胞、CAVIN3+ IGF2+ 内皮细胞和 EBF1+ 成纤维细胞。此外，鉴定了一组组织驻留的 NK 细胞，它们显示出病毒防御功能，在第 730 天保持增殖特征，并在人类肝脏中表现出比小鼠肝脏更高的保守转录因子表达模式。
图1 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq）鉴定发育中的肝细胞类型
图2 不同的肝细胞异质性和TF在发育过程中的动态活性
