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植物指纹图谱开发
植物指纹图谱开发
植物指纹图谱开发
简要概述

DNA 指纹图谱技术(DNA-Fingerprinting)是由英国科学家 Jeffreys 于 1986 年开发,具有丰富的多态性,高度的个体特异性和环境稳定性,可以像人类指纹一样用来区分不同的个体。DNA 指纹图谱具有快速、准确等优点,是鉴别品种、品系的有力工具,已广泛应用于很多作物的品种资源多样性和纯度鉴定研究。

应用场景
01. 遗传多样性评估
遗传多态性指标计算。
02. 种质资源的鉴定
筛选核心的标记。
03. 建立地方品种鉴定标准
申请相关知识产权。
04. 实现种质资源的管理
鉴定模型可搭载智能平台。

技术优势
  • 检测
    效率高

    结合KASP、质谱和芯片,实现低成本快速鉴定。

  • 标记
    多态性高

    SNPs基因组中丰富,具有数量大、基因组分布广、稳定。

  • 鉴定
    准确性高

    分子标记鉴别不易受环境影响,鉴定准确性高。

  • 成本低

    筛选核心种质资源,节省表型调查的成本。

技术流程
优秀案例
萝卜 SNP 指纹构建和遗传多样性分析
本研究基于46份代表性的萝卜种质的测序数据,包括本地栽培品种、杂交种和商业品种,通过严格的质控获得308个高质量的SNP集。根据染色体上分布、KASP标记转化、检出率验证等筛选32个候选核心标记,评估356个萝卜种质的遗传多样性、群体结构。最终根据挑选15个核心标记对356个萝卜品种构建指纹图谱,为萝卜种质资源鉴定和遗传研究提供依据。


参考文献
Xing, X., Hu, T., Wang, Y., Li, Y., Wang, W., Hu, H., Wei, Q., Yan, Y., Gan, D., Bao, C., & Wang, J. (2024). Construction of SNP fingerprints and genetic diversity analysis of radish (Raphanus sativus L.). Frontiers in plant science, 15, 1329890. https://doi.org/10.3389/fpls.2024.1329890
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