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简要概述

全基因组选择(Genomic Selection,简称GS)育种可通过构建预测模型,根据基因组估计育种值(Genomic Estimated Breeding Value, GEBV)进行早期个体的预测和选择。相比于传统的分子标记辅助选择育种,GS 育种无需进行标记显著性测验,特别适用于低遗传力以及难以测量的复杂性状。随着计算机科学和测序技术的发展,GS将会进一步得到广泛应用,将助力育种迈向4.0时代。

技术优势
  • 周期短

    缩短育种周期,实现待选群体的低世代选留

  • 准确性高

    提高育种值估计准确性

  • 成本低

    降低育种成本,减少表型测定的数量

  • 精准选择

    预测亲本杂交后代,选择最佳杂交优势组合

技术流程

合作案例

1.项目材料:816份大豆最初来自不同的地理起源,包括美国、意大利、加拿大等国外品种,中国内蒙古、黑龙江省、辽宁省和吉林省等不同纬度地区的 246 份种质资源和高世代稳定品系。

2.基因型数据:中豆芯一号检测。

3.分析模型:ABLUP、GBLUP 和 HBLUP 模型。

4.表型数据:开花期(R1)、成熟期(R7),收获后测定小区产量(Yield)、百粒重(100-eedweight)、蛋白含量(Protein)、脂肪含量(0i)。

5.研究结果:本研究利用 5fold 交叉验证,比较预测 GEBV与表型的相关性,结果表明 GBLUP 方法预测准确度最高,预测效果均优于 HBLUP、ABLUP,以系谱关系构建的 ABLUP 模型在所有性状中的预测准确度最低,充分证明了可以利用中豆芯一号对大豆进行分子育种分析及预测。


Rujian Sun, Liquan Qiu., et al. "Dissection of the practical soybean breeding pipeline by developing ZDX1, a high-throughput functional array." Theor Appl Genet. 2022 Apr;135(4):1413-1427.
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