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产品介绍

中国科学院海洋研究所贝类课题组研制开发,并联合北京华亿体育_华亿(中国)公司农业科技有限公司共同推出近江牡蛎30K育种芯片,产品基于CAGT®靶向捕获测序技术平台,在前期自主开发的牡蛎高密度200K芯片的基础上,精选位点后开发出的国内首款专门针对近江牡蛎的基因分型芯片。

物种

Crassostrea ariakensis

基因组大小

614.05M

位点数

30K

位点类型

SNP

平台

华亿体育_华亿(中国)公司CAGT®靶向捕获测序

表1 “臻珠1号”育种芯片位点组成及分布数量
应用场景
育种应用
全基因组选择育种
种质资源鉴定
种质资源保护
种群纯度检测
亲缘关系鉴定
经济性状评估
基础科研
全基因组关联分析(GWAS 分析)
全基因组连锁分析(QTL 分析)
精细定位
群体遗传学分析(进化、驯养、遗传多样性)


数据表现

“鲤育一号”育种芯片 — MAF分布

样本一致性

对应关系

结果一致性(%)

R1

AA1

98.58

R2

AA2

98.54

R3

AA3

98.56

R4

AA4

98.53

R5

AA5

98.38

R6

AA6

98.42

R7

AA7

98.38

R8

AA8

98.33

R9

AA9

98.23

R10

AA10

97.99

R11

AA11

97.98

R12

AA12

98.01

R13

AA13

97.92

R14

AA14

97.19

R15

AA15

97.22