动植物基因组de novo组装(De novo assembly)在不依赖参考基因组的情况下对某物种进行基因组测序及拼接组装,从而绘制该物种的全基因组序列图谱,并进行基因组结构注释、功能注释、比较基因组学分析等一系列的后续分析。基因组de novo组装不仅可以获得该物种的全基因组序列图谱,同时也为后续物种起源进化及特定环境适应性的研究奠定了基础。
能有效处理高 GC 含量、高重复序列的复杂基因组。
结合不同测序技术和优化的组装算法,提升基因组图谱的质量。
可深入了解物种的起源、演化历史和亲缘关系,为进化生物学研究提供关键数据。
有助于发现与重要生物学性状相关的功能基因,为基因功能研究提供靶点。
图1 牛基因组从头组装的全图景
图2 牛免疫球蛋白位点