转录组是指一个细胞、组织或生物体在特定条件或状态下转录的所有RNA集合。转录组测序能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的信使RNA（mRNA），并可以定量检测基因表达水平，发现新的转录本，分析基因结构变异，以及识别基因表达调控网络，是揭示基因功能和调控机制的重要手段。
能够全面、定量地检测细胞、组织或生物体内所有转录本的表达水平。
能够发现新的基因以及基因的可变剪切事件。
即使对于极低丰度的转录本也能进行准确检测，提高了研究的灵敏度和准确性。
适用于多种样本类型，提供了更广泛的研究对象和应用场景。
本研究收集了435个转录组数据，对20个山羊组织的组织特异性表达基因（TSGs）进行了鉴定，发现睾丸中TSG的数量最多。研究人员鉴定了山羊睾丸TSGs在山羊、绵羊和人类之间的保守性。获得了总共95个高度保守的TSG（HCTSG）、508个中度保守的基因（MCTSG）和42个非保守的TSG（NCTSG）。随后对ASE基因在山羊睾丸中的分布进行了研究，经过滤、筛选和注释后，在睾丸中获得总共644个ASE基因，包括88个组织特异性ASE (TS-ASE)基因（如FSIP2, TDRD9），这些ASE基因和TS-ASE基因都与山羊雄性生殖有关。
图1 RNA-Seq数据显示良好的组织类型聚类
图2 保守的睾丸TSG在精子发生中具有重要功能
